Servidores

O LGHM dispõe de cinco servidores (Ada, Darwin, Eva, Mendel, Noé), que executam atividades voltadas para ensino, pesquisa e análises bioinformáticas.

Principais características:

Ada - Servidor de Processamento

Processador AMD Ryzen Threadripper, 3960X, 24C/48T, 3.8/4.5GHZ.
Memória 128 GB (8x16GB), DDR4-3000 RAM expansível até 512GB.
HDD 30TB SATA 7.2KRPM.
SSD 250GB M.2 NVMe.
GPU - NVIDIA RTX 3090, 24GB, GDDR6X 10496 CUDA Cores.

Darwin - Servidor de Processamento

Processador Intel Xeon 3.0 GHz
Memória 28GB
Disco 31T

Eva - Servidor de Processamento

Intel core i9-10900K, 10C/20T, 3.7/5.3GHZ.
Memória 128GB DDR4-3000.
HDD 30TB SATA 7.2KRPM.
SSD 250GB M.2 NVMe.
GPU - NVIDIA RTX 3070, 8GB, GDDR6 5888 CUDA Cores.

Mendel - Servidor Web

Processador Intel core i5, 3.4Ghz, core 4
Memória 4GB
Disco 1TB

Noé - Servidor de Processamento

Um frontend - 2x Intel Xeon 8x2 2.33GHz 64GB RAM
Dois nodos - 2x Intel Xeon 8x2 2.9GHz 128GB RAM
Um storage _ Power Vault 3200, 4X 12TB HD
Um switch gigaeth
Um switch infiniband

ROSALIND - Servidor de Processamento e Armazenamento

PROCESSADOR E GRÁFICOS (PROCESSOR AND GRAPHICS)

Chip: Apple M2 Ultra
- CPU: 24 núcleos (24C), que incluem núcleos de alto desempenho e eficiência para otimizar multitarefas e cargas de trabalho pesadas.
- GPU: 76 núcleos (76C), oferecendo alto desempenho gráfico, ideal para aplicações de aprendizado de máquina.

MEMÓRIA (MEMORY)

Capacidade: 192 GB de memória unificada.

ARMAZENAMENTO (HARD DRIVE/SOLID STATE DRIVE)

Capacidade: 8 TB de armazenamento SSD (Solid State Drive).

PORTAS (THUNDERBOLT AND CONNECTIVITY)

8 portas Thunderbolt 4
3 portas USB-A
2 portas HDMI
2 portas Ethernet

ZTRON Pro - Solução avançada de bioinformática, projetada para atender às demandas de armazenamento, processamento e análise de dados genômicos em larga escala, oferecendo alto desempenho.

Armazenamento (Storage):

Velocidade de leitura: ≥ 1.5 GB/s (thread única).
Largura de banda agregada: > 4 GB/s, garantindo alta taxa de transferência.
Espaço disponível: > 500 TB, adequado para grandes volumes de dados genômicos.

Processamento (Computing):

Equipado com dois servidores ZBOLT, cada um com:

CPU: 64 núcleos ou mais, otimizados para cargas de trabalho intensivas.
Memória RAM: 512 GB ou superior para processamento eficiente.
Armazenamento:
- 2 SSDs SATA M.2 de 480 GB para o sistema.
- 2 SSDs NVMe de 1.92 TB para cache de alta velocidade.
GPU: 2x Nvidia Tesla T4 para aceleração computacional.
FPGA: Acelerador especializado para análise bioinformática.

Rede (Network):

Dois switches empilhados, oferecendo:

Portas ópticas:
- 18x 10/25 Gbps e 4x 40/100 Gbps para comunicação de alta velocidade.
Portas Ethernet: 10/100/1000 Mbps para conectividade adicional.
Módulos de fibra: 5x 10G SR e 5x 1000 Base-T

Software:

ZLIMS PRO System: Sistema de gerenciamento de informações laboratoriais.
Licença de análise WGS/WES para até 10.000 amostras de 30X WGS.
Pipelines de análise pré-configurados para Whole Genome Sequencing (WGS) e Whole Exome Sequencing (WES).